168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0670 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  94.86 
 
 		 214 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  39.53 
 
 		 181 aa  88.2  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.56 
 
 		 173 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.77 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  34.76 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  32 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  31.33 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  34.15 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  35.62 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  35.17 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  33.73 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  38.14 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  42.19 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  36.36 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.12 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.63 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  43.22 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  34.09 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  31.87 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.67 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.32 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.67 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.43 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.67 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.06 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.52 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  45.78 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.8 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.09 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.21 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  40.74 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.84 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.74 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  32.4 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  39.33 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.83 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  33.59 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.71 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  31.45 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  36.28 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.98 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  38.83 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  40 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.1 
 
 		 157 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  36.02 
 
 		 162 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  33.91 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  28.36 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  33.9 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  26.79 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  33.33 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  32.12 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  30.25 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  29.22 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  39.36 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  31.16 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.03 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  30.3 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  40.23 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.16 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.9 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  28.03 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.51 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  36.46 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  27.81 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  40 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  34.23 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.35 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.92 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.38 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  36.26 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  42.11 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  41.94 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  26.75 
 
 		 163 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.06 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.13 
 
 		 170 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  34.74 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  40.98 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  44.26 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.13 
 
 		 170 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  40.98 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  36.14 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  37.68 
 
 		 111 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.09 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.11 
 
 		 163 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  29.93 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  30 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 144 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.85 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>