93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2713 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 172 aa  343  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  49.43 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  45.71 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.03 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.67 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.07 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.52 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  39.39 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.51 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.51 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.97 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.36 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.42 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.42 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.42 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.83 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  40 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.32 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.12 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  33.53 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  38.29 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  38.29 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.04 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  38.51 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  36.78 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  39.88 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  32.37 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  35.84 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  38.1 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  29.19 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  34.88 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  32.39 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.71 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  38.82 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  32.31 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  29.31 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.77 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.02 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  34.12 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  34.12 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.14 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.85 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  37.21 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  23.78 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.1 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.37 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  33.67 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.47 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.35 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.87 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  26.25 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  27.75 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  27.06 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  32.58 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  29.47 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  29.41 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.88 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  38.16 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.25 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.93 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.68 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  34.85 
 
 		 188 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.2 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  23.95 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.08 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  26.53 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.55 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  29.49 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  32.94 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  22.98 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  21.85 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  26.44 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.94 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  23.86 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  25.51 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  35.59 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  32.43 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  25.26 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  32.79 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1707  putative type IV pilus assembly protein FimT  32.22 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  33.33 
 
 		 178 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1769  fimbrial protein FimT  31.87 
 
 		 170 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  26.32 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.56 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  26.97 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  36.84 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>