132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1166 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  98.17 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  98.17 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  98.17 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  77.44 
 
 		 164 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  56.17 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  52.69 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  52.5 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  52.5 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.79 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  51.2 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  52.83 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  53.33 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.6 
 
 		 178 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.83 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  45.86 
 
 		 170 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  40.13 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.27 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.28 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.22 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.22 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.59 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.59 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.03 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.61 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.73 
 
 		 173 aa  94  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.13 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  29.76 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  29.17 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  31.82 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.62 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  39.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30.06 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.38 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  26.92 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  36.59 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.05 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  31.97 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  31.97 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  35.63 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.85 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  28.05 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  28.91 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  33.33 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  22.01 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  39.76 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  33.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  28.4 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.45 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.06 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.82 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  30.19 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  32.28 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  38.1 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  29.92 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  39.29 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.4 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.93 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.54 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  27.33 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.57 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  32.03 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  30.06 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.69 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.46 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  31.82 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.33 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  25.85 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.7 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  36.67 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.78 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.91 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  31.82 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  31.33 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.96 
 
 		 218 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  33.06 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.01 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  30.97 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  32.14 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.57 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.41 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  37.21 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36.36 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  30 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  35.09 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.36 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  27.64 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  27.03 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  27.59 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  31.71 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>