163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2664 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 
178 aa  350  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  38.66 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  31.03 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  35.36 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  33.52 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  36.36 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  39.55 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.32 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.33 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.33 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  31.61 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  39.77 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  28.74 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  45.45 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  39.29 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  28.4 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  44.26 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  35.96 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  35.04 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  31.36 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  36.9 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.48 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  27.54 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  40.32 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  35.79 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.79 
 
 
162 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  28.34 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  36.07 
 
 
147 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  32.16 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  27.21 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.41 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  27.43 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  31.85 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2834  protein involved in methylation  34.72 
 
 
171 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.307556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  37.35 
 
 
206 aa  51.6  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  29.21 
 
 
145 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.48 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  28.57 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.71 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.56 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  26.71 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  26.71 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  29.41 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  31.82 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  29.21 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.37 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  30.16 
 
 
166 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  39.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  30.13 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  29.19 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.29 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.37 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.37 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  26.09 
 
 
144 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  29.92 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  31.1 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  34.94 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  34.94 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.53 
 
 
203 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  29.03 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  34.92 
 
 
152 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  29.21 
 
 
145 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  28.35 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.21 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  22.6 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.94 
 
 
164 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  32.26 
 
 
111 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  30.39 
 
 
189 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  33.67 
 
 
200 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.44 
 
 
186 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.68 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.09 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  38.98 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  27.88 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  29.47 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.71 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  24.82 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  22.38 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  34.56 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.98 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  47.22 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  27.97 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  34.15 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  27.64 
 
 
151 aa  44.7  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  42.5 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  27.64 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  35.63 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  33.77 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  33.62 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.77 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  35.37 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  35.37 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  25.42 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  34.21 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.11 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.18 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  26.23 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>