177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2665 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2665  methylation  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  38.98 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  36.36 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.46 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  32 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.94 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  29.89 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.55 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  32.41 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.59 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.9 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.59 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.5 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  28.33 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.2 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  30.95 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  32.22 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  32.61 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  30.39 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.9 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.81 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.65 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  23.46 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  28.32 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.53 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.75 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.75 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.75 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  33.9 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.75 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  25.73 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.6 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  30 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  29.44 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  37.8 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  37.8 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.88 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.1 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  32.46 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.7 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  26.81 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  27.98 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.67 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.14 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.94 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.97 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  25 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  27.71 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  27.71 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.15 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  27.81 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.15 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  27.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.52 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  23.26 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.71 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  23.98 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  23.85 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  39.19 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  35.06 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  35.06 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.14 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  37.04 
 
 		 146 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4555  type IV pili biogenesis protein FimT  24.72 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.691315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  40.28 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  40.28 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  40.28 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  40.68 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.29 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  40.28 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.44 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  23.95 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  27.01 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  30.49 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  31.4 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  26.78 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  35.8 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  40.28 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  25.7 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  32.98 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  24.55 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  34.52 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  37.29 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.69 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  25.7 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  24.12 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>