257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0722 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  32.02 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.9 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  28.9 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  27.37 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  40 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.63 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  35.56 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  29.55 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.6 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  28.42 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.91 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.23 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.74 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.34 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  31.71 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.07 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0489  methylation  30.14 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  40.26 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  27.64 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  35.64 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  26.37 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.27 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  38.96 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.29 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.02 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  32.45 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.46 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  28.33 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  36.84 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.15 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  27.12 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  34.09 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  34.09 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.35 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  25.28 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.86 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.69 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  31.68 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  35.56 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.74 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  36.84 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.85 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  26.88 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  30.82 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  34.44 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.08 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.17 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.8 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.33 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  39.51 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.71 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  25.4 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.86 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.37 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.71 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  37.1 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  25.57 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.84 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  33.71 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  31.58 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  26.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  47.62 
 
 		 168 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  29.41 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  38.46 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  39.73 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  29.23 
 
 		 161 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  26.74 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0716  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  24.59 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  39.73 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  32.98 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  42.86 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.29 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  27.65 
 
 		 171 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.93 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  34.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  30.32 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.76 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  40.74 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  50 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  35.62 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  28.72 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  35.06 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.25 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  32.43 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45 
 
 		 146 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.93 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  50 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  40 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  27.21 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  28.57 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>