32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2154 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  345  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0988  hypothetical protein  60.71 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2037  hypothetical protein  37.11 
 
 		 161 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  32.26 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  36.02 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  28.3 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  27.04 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  37.31 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.43 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  27.73 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1172  hypothetical protein  29.94 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  29.7 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  37.04 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0651  methylation site containing protein  28.42 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  28.35 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.15 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  22.63 
 
 		 148 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  23.4 
 
 		 177 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.5 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  24.49 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  25 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  23.26 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.54 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  24.79 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  22.86 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  31.48 
 
 		 186 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  32.73 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  29.85 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  55.56 
 
 		 168 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  30.36 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>