32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1122 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  28.1 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  30.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.11 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  29.27 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  27.52 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  28.21 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  29.31 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  26.49 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  35 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2612  hypothetical protein  30.38 
 
 		 279 aa  44.3  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  31.75 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  26.32 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0994  N-terminal methylation protein  29.41 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  27.4 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.74 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  34.09 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  36.76 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  31.82 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  38.78 
 
 		 135 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  26.42 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  25 
 
 		 177 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  33.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1025  hypothetical protein  22.01 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  31.94 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  30.36 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  38.89 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  24.64 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.14 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>