73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1302 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 148 aa  291  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  49.32 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  47.3 
 
 		 148 aa  129  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  33.78 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  30.28 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  35.42 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  27.86 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  28.1 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  34.04 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  28.26 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  32.12 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  27.14 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  27.14 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  30.17 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  35.82 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  26.81 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  25.69 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  34.29 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  34.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  22.92 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  33.67 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  25.32 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.29 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3597  hypothetical protein  36.92 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  29.66 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  29.7 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  32.81 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  32.28 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  49.06 
 
 		 701 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  40.82 
 
 		 143 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  28.95 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  36.23 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.93 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  57.58 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.93 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  33.73 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  33.85 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  35.38 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  35.94 
 
 		 313 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  38.75 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0236  hypothetical protein  60.61 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  46.67 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  57.58 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  52.78 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  27.63 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 145 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 145 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 145 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>