44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4157 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 148 aa  289  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  63.27 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  47.3 
 
 		 148 aa  129  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  29.86 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  31.43 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  31.62 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  33.33 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  29.79 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  30.23 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  33.01 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  30.94 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  27.52 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  38.98 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  39.06 
 
 		 170 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  30.85 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  24.65 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  28.47 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  49.09 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  37.7 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2678  hypothetical protein  33.87 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000820261 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  38.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.78 
 
 		 195 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  47.27 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  26.06 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  34.72 
 
 		 313 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3597  hypothetical protein  32.5 
 
 		 149 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.47 
 
 		 178 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  24.74 
 
 		 145 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.92 
 
 		 155 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.57 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  34.38 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  33.87 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1805  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.82 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  27.85 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.85 
 
 		 188 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>