26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1117 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 141 aa  278  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  34.48 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  33.83 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  34.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  33.09 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  33.09 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  31.62 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  35.56 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  32.12 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  28.24 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  35.58 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  28.47 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  30.53 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  56.1 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  31.82 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  27.59 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  26.72 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  26.72 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  25.37 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.71 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  30 
 
 		 140 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  23.48 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  26.47 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  25.2 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1610  hypothetical protein  35.96 
 
 		 138 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.411138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>