22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0859 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 168 aa  336  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  100 
 
 		 168 aa  336  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  65.47 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  58.62 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  34.27 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  32.87 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  31.58 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  33.79 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  33.09 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  30.34 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  27.86 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  27.14 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  28.26 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  24.79 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  23.53 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  30.61 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  37.21 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  37.21 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>