44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1281 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  100 
 
 		 154 aa  306  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  54.67 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  56.93 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  53.52 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  49.26 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  51.01 
 
 		 163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  30.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  27.86 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  30.34 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  28.26 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  28.26 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  30.14 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  30.53 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1784  hypothetical protein  30.34 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  27.74 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  25 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  38.1 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  36.21 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  23.24 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  32.61 
 
 		 202 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.51 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1011  hypothetical protein  28.95 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.60577e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  32 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.06 
 
 		 168 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  31.96 
 
 		 174 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  31.07 
 
 		 173 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  54.29 
 
 		 164 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.42 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  29.13 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  43.75 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  26.72 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.34 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  47.5 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.65 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.62 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  39.58 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  41.51 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.31 
 
 		 161 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  41.51 
 
 		 168 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  32.76 
 
 		 111 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>