19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02679 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  65.47 
 
 		 168 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  65.47 
 
 		 168 aa  195  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  58.39 
 
 		 164 aa  160  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  35.61 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  36.64 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  35.61 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  35.4 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  34.33 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.65 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  31.3 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  22.56 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  40.86 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  30.17 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  28.24 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  33.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  28.03 
 
 		 157 aa  43.5  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  30.09 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  23.66 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>