26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3148 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  94.44 
 
 		 144 aa  276  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  49.65 
 
 		 146 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  36.96 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  35.61 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  30.77 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  30.28 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  32.17 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  32.86 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  31.43 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.93 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  28.57 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  30.77 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  27.78 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  30.3 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  26.98 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  26.98 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  23.24 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  26.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0924  general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 151 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  normal  0.859469 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.49 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  26.47 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>