70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2892 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  35.61 
 
 		 141 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  36.43 
 
 		 144 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  35.71 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  32.14 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  32.61 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  32.61 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  35.11 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  32.85 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  31.47 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  34.04 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  34.04 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  30.99 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  30.6 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  30.97 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  29.93 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.41 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  33.12 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  30.83 
 
 		 139 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  33.33 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  44.44 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  31.46 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.5 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  28.42 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  23.97 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.86 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  26.09 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  29.87 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.18 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  31.82 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  27.46 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  36.49 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  23.19 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.88 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  36.84 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  39.29 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.34 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  27.69 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  32.39 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.73 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  38.81 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  35.94 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0676  hypothetical protein  28.8 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  27.87 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  36.84 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.53 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.15 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.92 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  36.07 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  28.74 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  30.26 
 
 		 203 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0297  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3435  hypothetical protein  31.08 
 
 		 141 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  30 
 
 		 163 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  24.16 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  30.21 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  40.38 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.73 
 
 		 193 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.81 
 
 		 222 aa  40.8  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.24 
 
 		 170 aa  40.4  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>