27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2110 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  100 
 
 		 163 aa  314  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  54 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  61.59 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  51.01 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  55.03 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  55.65 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  35.86 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  32.19 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  28.97 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  31.97 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  30.87 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1784  hypothetical protein  40.41 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  25.87 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1025  hypothetical protein  24.24 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  28.48 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.21 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  30.77 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  38.71 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  30.09 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  25.17 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.61 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  30.41 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.81 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  25 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.2 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>