51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0913 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 153 aa  304  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  54.11 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  53.52 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  50.72 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  55.03 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  45.61 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  32.62 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  31.47 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1784  hypothetical protein  36.05 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.29 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  29.66 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  28.17 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  25.18 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  24.82 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  25.18 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2031  putative general secretion pathway protein H precursor  36.04 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00566537  normal  0.0245477 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  27.59 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  27.59 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  43.28 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.62 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.99 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  32.69 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  27.94 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  30.33 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  26.83 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  41.67 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.34 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  38.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  47.17 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.94 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.76 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  28.36 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  31.4 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  30.4 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  45.24 
 
 		 148 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  32.5 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  38.6 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  27.5 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.49 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  56.25 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  43.48 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  40.82 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  42.22 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  58.06 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  40.43 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  29.32 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54.84 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  34.21 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.67 
 
 		 168 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>