More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0263 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.72 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  42.47 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  42.47 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.26 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.26 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.29 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  41.25 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  41.94 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  41.94 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  48.1 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  46.84 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  51.14 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  50 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.04 
 
 		 152 aa  62  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.83 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.03 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.23 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  39.5 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  29.09 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  29.09 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.86 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  29.09 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  38.24 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  29.36 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.46 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  34.62 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.54 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  43.55 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.12 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  35.53 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.48 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.31 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.15 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  46.27 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  29.87 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.06 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  42.31 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  41.1 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  40.54 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  51.92 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  32.05 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.56 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  33.7 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.58 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  40.28 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  27.83 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  38.81 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  45 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.29 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  31.88 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  38.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>