24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0549 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 164 aa  321  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  58.62 
 
 		 168 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  58.62 
 
 		 168 aa  164  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02679  general secretion pathway protein H  58.39 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  36.96 
 
 		 144 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  39.01 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  35.51 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  35.21 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  33.09 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  32.73 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  35 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0891  hypothetical protein  40.86 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000181606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  29.79 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  24.65 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0685  general secretion pathway protein H  31.79 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  28.28 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  31.13 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  27.74 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  21.64 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  32.19 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  29.37 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1610  hypothetical protein  38.38 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.411138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  24.32 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>