136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0971 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 173 aa  347  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  31.76 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  29.22 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  27.89 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  29.23 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  30.67 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  38.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  27.49 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.32 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  32.39 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  29.94 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  25.62 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  31.09 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2705  hypothetical protein  32.03 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.349315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1025  hypothetical protein  27.95 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  29.27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.87 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  38.1 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  31.36 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.82 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  37.5 
 
 		 189 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.21 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2368  hypothetical protein  27.74 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.48 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0994  N-terminal methylation protein  31.79 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  28.83 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  38.18 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  28.39 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  31.82 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  38.1 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  29.35 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  34.43 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  36.36 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  48.33 
 
 		 567 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  36.62 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1016  hypothetical protein  21.29 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  40.35 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  28.99 
 
 		 225 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  48.98 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  26.71 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  48.39 
 
 		 548 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.94 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  36.36 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  41.07 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  32.79 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.75 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3435  hypothetical protein  27.15 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  30.3 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4142  comG operon protein 4  23.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3982  comG operon protein 4  23.61 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3992  comG operon protein 4  23.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4463  ComG operon protein 4  23.61 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0624638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  27.94 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.94 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  39.66 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  24.86 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.07 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  34.55 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.35 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  32.2 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  32.2 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  25 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  44.23 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  28.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  28.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  35.38 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  34.52 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  60 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  25.25 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  50.94 
 
 		 527 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  41.3 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4261  comG operon protein 4  23.61 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  33.82 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  40.35 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  23.9 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  42.55 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  30.56 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  23.9 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  48.65 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.76 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2612  hypothetical protein  30.77 
 
 		 279 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  32.31 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.49 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  50.94 
 
 		 634 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0525  pilin assembly protein  27.01 
 
 		 132 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4371  comG operon protein 4  22.92 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>