230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0717 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  98.03 
 
 
203 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  97.54 
 
 
203 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  69.54 
 
 
203 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  27.41 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  28.67 
 
 
144 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  61.11 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.9 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  43.55 
 
 
154 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  50 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  45.1 
 
 
138 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  30 
 
 
143 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  49.06 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  26.29 
 
 
160 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  50 
 
 
157 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
158 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
144 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  62.07 
 
 
111 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  49.18 
 
 
129 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  51.61 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  53.33 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  50 
 
 
114 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  46.34 
 
 
118 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  67.86 
 
 
174 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  46.34 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  32.65 
 
 
178 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  57.14 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
153 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  47.17 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  49.02 
 
 
153 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  53.12 
 
 
143 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
144 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.43 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  33.57 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  60 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  62.07 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  59.38 
 
 
139 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  43.28 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  40.58 
 
 
567 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.67 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  45.83 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  41.82 
 
 
137 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
147 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  45.83 
 
 
150 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  57.14 
 
 
134 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  51.22 
 
 
140 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  29.09 
 
 
147 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.06 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  41.79 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  39.39 
 
 
138 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  26.8 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  38.27 
 
 
133 aa  45.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  54.29 
 
 
168 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  58.62 
 
 
153 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  36 
 
 
349 aa  45.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  47.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
162 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
152 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 
154 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  54.55 
 
 
148 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  40.32 
 
 
148 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  54.29 
 
 
178 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  54.55 
 
 
142 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  45.28 
 
 
146 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 
151 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.67 
 
 
167 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  31.39 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  58.62 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  54.29 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  55.88 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  40.28 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  35.21 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  48.89 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  54.29 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  53.66 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>