175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3368 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0325  general secretion pathway protein H, putative  54.75 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  46.51 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  44 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  44.03 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1277  general secretion pathway protein H  35.12 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  29.23 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.77 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  43.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  33.67 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  30.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  35 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  38.33 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  32.65 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2154  hypothetical protein  29.37 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  43.1 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  26.99 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  41.38 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  31.78 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  39.73 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  34.94 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  37.84 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.43 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.55 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  27.98 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  43.48 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.66 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  38.6 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  25.15 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  31.78 
 
 		 138 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  32.63 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.22 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  29.38 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  40.32 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.83 
 
 		 163 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  72 
 
 		 129 aa  44.3  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  56.25 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  43.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  38.6 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.4 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1796  hypothetical protein  29.5 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.501764 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  61.29 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.23 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  39.62 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  43.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  27.22 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  37.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  33.33 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  36.11 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  32.93 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  51.28 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.16 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.35 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  59.26 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  35.51 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  69.23 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  35.51 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  40.68 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  47.83 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  50 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.63 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  45.24 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  29.81 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  40.35 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  41.1 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  54.84 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  40.91 
 
 		 70 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.72 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  36.54 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.71 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.78 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  36.84 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.5 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  24.54 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  23.9 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.63 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.62 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.47 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  30.43 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  44.83 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  55.17 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  32.95 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  54.84 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.78 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.63 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>