More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1999 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  100 
 
 		 153 aa  305  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.37 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  43.15 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  42.86 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  35.22 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  45.07 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  37.75 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  40.41 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  39.01 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  43.94 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  37.09 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  32.03 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  36.99 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  36.62 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  37.16 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  39.67 
 
 		 169 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  38.56 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  46.43 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  54.69 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  48 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  52.63 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  35.38 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  32.17 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  42.18 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  57.63 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  51.61 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  56.72 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  49.21 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.57 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50.82 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  65.91 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34.27 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  40.57 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  43.08 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  39.86 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  29.94 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  38.56 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  57.14 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  36.65 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  49.15 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  31.14 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  57.14 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.25 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  48.33 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  50.77 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  44.19 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.21 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.95 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  50.94 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  39.6 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  44.29 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  49.12 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  49.12 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  40 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.37 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.64 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  47.69 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.19 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  49.15 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  39.04 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  31.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  31.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  31.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  31.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.56 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  35.17 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  60 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  52.94 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  72.22 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48.28 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.31 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  43.08 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  48.44 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  42.19 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  34.23 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.76 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  49.21 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  46.55 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  32.64 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  30.77 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.88 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  47.17 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>