More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4155 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  100 
 
 		 188 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  73.17 
 
 		 111 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  51.61 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  75.61 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.27 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  75.61 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  36.36 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  48.48 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  65.96 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  65.22 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  44.44 
 
 		 138 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  51.92 
 
 		 141 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  69.05 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  78.95 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.48 
 
 		 142 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  69.05 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  71.43 
 
 		 136 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  73.17 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  73.17 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  69.05 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.02 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  53.85 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  69.77 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  64.44 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.06 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  68.42 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  42.86 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  63.46 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  63.04 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  70.73 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.48 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  63.04 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  73.68 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  68.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  40.26 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.05 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.15 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  73.68 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  65.91 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  68.09 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  49.18 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  47.54 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  70 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.06 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  73.68 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  50 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  37.17 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  53.85 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.55 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  66.67 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  71.79 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  73.68 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  54.24 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  64.29 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.25 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  52.17 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  50.94 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  58.82 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  46.75 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  50.94 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  30.63 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.3 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  47.54 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.06 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  54.17 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.86 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  60.42 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  46.75 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.49 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42.31 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  54.17 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  71.05 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  68.57 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  47.27 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  48.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.3 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  41.89 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.08 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  68.42 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.61 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  53.49 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  50 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.5 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  52.08 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46.3 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46.3 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  59.52 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.06 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>