26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2669 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1139    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  28.86 
 
 
701 aa  160  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  40.68 
 
 
114 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  33.7 
 
 
168 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  31.01 
 
 
148 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.67 
 
 
176 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  47.06 
 
 
140 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  40.58 
 
 
203 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  45.9 
 
 
203 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.67 
 
 
176 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  41.07 
 
 
160 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  45.83 
 
 
153 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  70.37 
 
 
157 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  53.33 
 
 
203 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  50 
 
 
180 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  60 
 
 
121 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  40 
 
 
154 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  71.43 
 
 
163 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  60 
 
 
118 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
148 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.84 
 
 
141 aa  44.3  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
142 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  52 
 
 
168 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  31.34 
 
 
236 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  40.91 
 
 
209 aa  43.5  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  40.38 
 
 
144 aa  43.5  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>