167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4117 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4117  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  29.61 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  27.73 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  25.7 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.86 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  41.82 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  30.23 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  37.04 
 
 		 162 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  45.61 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.29 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  31.08 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  47.73 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  37.7 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.02 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  40.3 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.64 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  34.55 
 
 		 161 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.98 
 
 		 169 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  38.57 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 167 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  53.06 
 
 		 164 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  38.57 
 
 		 136 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  45.45 
 
 		 148 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  61.76 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.54 
 
 		 175 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  34.48 
 
 		 144 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 		 169 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  60.61 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  38.57 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.14 
 
 		 142 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  34.62 
 
 		 111 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  58.82 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 157 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  46.67 
 
 		 136 aa  45.1  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.35 
 
 		 163 aa  45.1  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  44.19 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.1 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  40.74 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  38.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.58 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  48 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  45.95 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  58.82 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  39.34 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07091  hypothetical protein  41.51 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.43 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  44.68 
 
 		 174 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  60.61 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.38 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.98 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  57.58 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  28.57 
 
 		 145 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  51.52 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  57.58 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  46.94 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  60.61 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  33.33 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  46 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  24.68 
 
 		 137 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  40.38 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  57.58 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08271  hypothetical protein  23.64 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.125475  hitchhiker  0.0000413407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  27.94 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  41.07 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  55.88 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2669  hypothetical protein  31.34 
 
 		 567 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.70163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  37.29 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.65 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  38.46 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  38.57 
 
 		 138 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.54 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  38.89 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  38.78 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  29.34 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.82 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.88 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  57.58 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.58 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  40.68 
 
 		 120 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>