More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0210 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
154 aa  317  3e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  55.84 
 
 
155 aa  179  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.53 
 
 
171 aa  132  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.87 
 
 
151 aa  124  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.04 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.28 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  45.03 
 
 
174 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.48 
 
 
156 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.1 
 
 
193 aa  109  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.75 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.86 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42 
 
 
163 aa  104  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.19 
 
 
152 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  52.78 
 
 
163 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  39.41 
 
 
171 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 
167 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.57 
 
 
170 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.23 
 
 
163 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.14 
 
 
156 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  59.55 
 
 
182 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.75 
 
 
165 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.18 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.13 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.93 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  67.12 
 
 
79 aa  98.2  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.84 
 
 
171 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.34 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.41 
 
 
165 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.37 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.29 
 
 
175 aa  94  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.1 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  41.04 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.53 
 
 
169 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
172 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  61.64 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  49.09 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.49 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.27 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  40.99 
 
 
164 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.46 
 
 
165 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  56.63 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.04 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  52.7 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  55.56 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  47.92 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.76 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  47.22 
 
 
169 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  63.16 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  45 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  45 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  41.38 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.7 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  32.88 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  32.88 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  50.82 
 
 
634 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
48 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  32.5 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.9 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  36.73 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.78 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  41.1 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  52.46 
 
 
527 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.87 
 
 
173 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  38.27 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  34.48 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  43.28 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  32.8 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.9 
 
 
174 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36 
 
 
168 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.24 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  34.04 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  33.01 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.63 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  38.1 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  37.33 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  51.67 
 
 
567 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  41.03 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.01 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  44.26 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  50 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.97 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.97 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  49.15 
 
 
548 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  44.78 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  29.1 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  29.32 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  41.1 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  28.97 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34.88 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.71 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>