223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0367 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  40.97 
 
 
143 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  37.14 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  35.66 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  35.17 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  31.58 
 
 
136 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  32.22 
 
 
210 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0706  hypothetical protein  28.97 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.769661  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1183  N-terminal methylation domain protein  28.66 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  44.83 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  42.86 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  42.86 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  42.86 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  42.86 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  40.54 
 
 
176 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  33 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  71.88 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  30.94 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  33.68 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  36.21 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  40.68 
 
 
180 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.55 
 
 
191 aa  48.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  49.02 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  39.06 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  25.74 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  45.65 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  45.65 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  47.73 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  44.68 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  42 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  36.47 
 
 
165 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  45.45 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36 
 
 
150 aa  47  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  31.58 
 
 
163 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  38.46 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  54.29 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  29.08 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  34.25 
 
 
191 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  36.14 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  54.05 
 
 
186 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  41.82 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  31.52 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  28.69 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  31.58 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  48.84 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  40.3 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  43.75 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  34.38 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  39.47 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  33.8 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  47.06 
 
 
177 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  61.76 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  45.65 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  39.71 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  32.88 
 
 
191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  37.25 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  61.76 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  42.86 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  26.36 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  54.29 
 
 
187 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  32.93 
 
 
229 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  38.89 
 
 
174 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  38.98 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  34.15 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  36.07 
 
 
211 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  28.26 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  43.48 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  48.48 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  36.07 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  44.19 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  28.67 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  48.57 
 
 
193 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  33.08 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  51.43 
 
 
192 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  60.61 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  60.61 
 
 
174 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  37.7 
 
 
195 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  40 
 
 
124 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  32.93 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  37.14 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  30.08 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  58.82 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  51.43 
 
 
201 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  40 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  42.31 
 
 
185 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  58.82 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  58.82 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  58.82 
 
 
169 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  34 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  40 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.38 
 
 
193 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  55.88 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>