More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0516 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  51.96 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  53.63 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  50.54 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  51.14 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  49.18 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  51.34 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  49.44 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  52.33 
 
 		 171 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  45.56 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  66.98 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  54.35 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  58.57 
 
 		 169 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  59.26 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  49.71 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  58.27 
 
 		 169 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  45.09 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  45.81 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  44.25 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  43.9 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  75 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  48.44 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  48.82 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  40.24 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  43.1 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  48.94 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  53.19 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  64.1 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  47.87 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  42.59 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  45.21 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  56.38 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  40.99 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  65.22 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  63.64 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  45.59 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  39.2 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  53.06 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  52.04 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  51.02 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  50 
 
 		 167 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  38.73 
 
 		 146 aa  84  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  60.32 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  45.1 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  46.94 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  46.88 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  47.17 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  55.13 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  55.13 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  55.13 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  55.13 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  54.41 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.91 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  33.73 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  56.92 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  64.91 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  65 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  62.3 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  50 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  50 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  60.66 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  52.94 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  52.94 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  42.99 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  54.67 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  54.55 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  32.12 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  54.84 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  55.71 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  42.31 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  60.34 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  39.22 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  39.22 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  33.13 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  39.22 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  39.22 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  61.82 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  34.38 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  30.43 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  46.25 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  45.88 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  52.38 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  47.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  44.71 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  48.24 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  48.24 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  44.71 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  34.58 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  34.58 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  34.58 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  52.73 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  34.58 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  55.77 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  44.78 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  61.9 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  38.46 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>