More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4569 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  100 
 
 		 187 aa  367  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  40.56 
 
 		 169 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  36.56 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  38.46 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  40.24 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  39.67 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  37.72 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  44.8 
 
 		 163 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  40 
 
 		 173 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  38.71 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  65.62 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  39.05 
 
 		 169 aa  91.3  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  36.41 
 
 		 176 aa  91.3  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  38.3 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  36.26 
 
 		 159 aa  90.9  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  36.13 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  35.94 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  38.33 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  37.64 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  36.99 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  35.96 
 
 		 168 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  39.58 
 
 		 151 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  36 
 
 		 170 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  47.52 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  62.5 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  35.88 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  60.94 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  61.9 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  36.14 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  36.26 
 
 		 172 aa  84.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  43.69 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  45.28 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  60 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  32.07 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  44.44 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  34.62 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  37.62 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  38.6 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  52.11 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  32.11 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  29.94 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  54.55 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  34.93 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  39.6 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  42 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  38.61 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  38.61 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  54.55 
 
 		 108 aa  72  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  38.61 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  38.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  38.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  38.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  38.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  40.78 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  38.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  45.83 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  55.17 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  64.29 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  37.62 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  31.76 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  31.76 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  42.45 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  37.96 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  42.45 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  30.5 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  33.53 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  36.7 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  35.24 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  36.19 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  31.18 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  31.18 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  54.55 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  31.18 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  46.58 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  46.97 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  43.14 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  43.14 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  29.79 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  43.14 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  42.06 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  28.65 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  43.14 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  30.18 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  31.03 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  28.9 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  58 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  58 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  38.83 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  39.66 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  51.79 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  46.97 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  40.38 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  56.14 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  45.21 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  43.75 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>