144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0067 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  46.15 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  54.41 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  48.05 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  48.05 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  32.32 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  48.65 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  46.75 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  46.99 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  48.05 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  50 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  49.35 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  41.23 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  41.82 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  34.58 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  37.17 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  42.7 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  38.26 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  39.36 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  39.47 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  51.52 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  33.14 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  47.76 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  32.28 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  41.49 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  54.84 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  49.3 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  47.76 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  30.18 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  48.57 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  48.57 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  49.28 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  48.57 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  31.29 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  39.13 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  51.61 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  40.22 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  43.96 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  47.06 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  54.84 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  44.29 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  48.48 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  45.21 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  36.47 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  35.71 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  37.21 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  34.12 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  41.33 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  32.63 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  35.8 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  48.44 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  51.56 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  48.44 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  48.44 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  48.44 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  32.63 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  40.98 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  44.64 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  54.35 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  38.98 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02411  hypothetical protein  34.52 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  46.15 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  31.54 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  48.21 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  45.45 
 
 		 189 aa  50.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  37.63 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  44.07 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  44.07 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  43.08 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  43.08 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  48.94 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  44.07 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  43.08 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  43.08 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2040  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  42.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  47.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.59 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  62.86 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  58.97 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  53.85 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  52.63 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  47.06 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  55.26 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  56.41 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  40 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  41.51 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  36.84 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  47.83 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  46.3 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  40.98 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  38.6 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>