More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4106 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  100 
 
 		 205 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  97.07 
 
 		 205 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  96.1 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  95.59 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0514  MSHA pilin protein MshB  94.15 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00061527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3829  MSHA pilin protein MshB  94.15 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0511  MSHA pilin protein MshB  93.17 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000086206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0490  MSHA pilin protein MshB  93.17 
 
 		 205 aa  387  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000965015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  89.27 
 
 		 205 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  77.56 
 
 		 205 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  77.39 
 
 		 201 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  73.37 
 
 		 201 aa  307  6.999999999999999e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  75.37 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  70.59 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  69.9 
 
 		 218 aa  285  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3762  methylation site containing protein  69.5 
 
 		 202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000262752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  40.48 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_002567  Pilin protein  44.76 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  37.04 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2826  MSHA pilin protein MshB  41.95 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  44.55 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  46.32 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  43.75 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  30.36 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  37.39 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  37.19 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  44.71 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  45.05 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  35.25 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  43.01 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  44.71 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  42.2 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  36.89 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  34.43 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  34.43 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  34.43 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.53 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  50 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  47.76 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0475  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHB)  40.26 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  36.57 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  36.84 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  41.18 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  39.81 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  40.7 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  46.34 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  36.7 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  32.52 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  38.82 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  42.67 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  42.22 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  41.24 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  40.59 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  41.89 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  33.87 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  41.98 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  29.91 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  44.78 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  44.59 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  46.27 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  33.9 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  44.26 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  46.55 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  45 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  46.27 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  40.91 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  40.91 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  38.89 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  38.16 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  38.16 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  38.16 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  38.16 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  31.39 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  39.47 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  34.23 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  63.04 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  44.78 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  32.56 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  44.78 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  38.38 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  51.72 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  35.96 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  42.42 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  40 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  37.17 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  56.82 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  35.09 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  33.93 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  59.09 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>