More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3444 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  100 
 
 		 167 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  97.6 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  97.01 
 
 		 167 aa  330  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  95.81 
 
 		 167 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  81.6 
 
 		 163 aa  278  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  83.83 
 
 		 167 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  82.21 
 
 		 164 aa  264  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  82.21 
 
 		 164 aa  264  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  82.82 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  63.92 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1388  methylation site containing protein  45.4 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  39.24 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  38.46 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  37.95 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  38.79 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  52.04 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  37.79 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3099  methylation site containing protein  34.44 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  39.16 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  35.5 
 
 		 178 aa  84.3  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  33.15 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  50 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  49.51 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  34.25 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3822  putative V10 pilin  34.16 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  33.14 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  34.39 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  33.71 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  36.16 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  31.96 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  62.12 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  31.29 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  29.48 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  48.05 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  33.33 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  55.26 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  38.78 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  34.64 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  32.52 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  32.77 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  29.89 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  33.92 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  59.65 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1380  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  30.18 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  62.5 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  60.34 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  60.34 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  60.34 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  60.34 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  29.05 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  44.87 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  62.07 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  52.17 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  51.67 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  40.4 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  41.84 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  37.3 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  36.59 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  51.72 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  41.79 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4255  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  32.02 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  53.7 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  46.03 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  43.33 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  48.39 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1972  prepilin-type cleavage/methylation  29.95 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  48.39 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  55.36 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  41.86 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  38.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  38.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  38.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  38.46 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  56.86 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  28.95 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2521  hypothetical protein  39.13 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  53.85 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  72.97 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  55.36 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  49.15 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  67.57 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  39.22 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  74.29 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  74.29 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  70.27 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  71.43 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  67.57 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1109  hypothetical protein  42.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  51.72 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  53.06 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  41.79 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  43.33 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  34.18 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  50.91 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  46 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>