142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2828 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  32.58 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  34.05 
 
 		 204 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  35.9 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  33.52 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  34.76 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  37.34 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  36.48 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  36.71 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  32.91 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  35.8 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  32.48 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  31.85 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  30.82 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  32.5 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  33.96 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  30.57 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  33.54 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  30.19 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  30.2 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  50.91 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  45 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  29.45 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  46.43 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  35.06 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  30.97 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  42.47 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  34.04 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  45.07 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  46.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  63.16 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  54.35 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2860  methylation site containing protein  45.45 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  27.95 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  43.66 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  45.61 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  51.11 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  52.17 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  55.56 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  43.66 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  81.48 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  43.08 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  69.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  53.33 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  81.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  53.33 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  30.28 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  69.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  69.7 
 
 		 201 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  73.08 
 
 		 156 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  53.33 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  70.37 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  66.67 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  37.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  59.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  59.38 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  47.83 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  42.65 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  47.27 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0321  hypothetical protein  45.45 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0183031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  77.78 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  52.17 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  77.78 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  65.71 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  25.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  24.17 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  51.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  51.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  28.08 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0327  methylation site containing protein  45.65 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0267191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  76.92 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  27.95 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  51.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  50 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  51.11 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  51.11 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  42.86 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  72.41 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  32.43 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  51.11 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  59.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  56.25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3480  methylation site containing protein  59.38 
 
 		 205 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000493749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0472  methylation site containing protein  59.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000795599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  59.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  59.38 
 
 		 201 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  59.38 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  76.92 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  70.37 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  76.92 
 
 		 151 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  70.37 
 
 		 171 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  43.64 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>