41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3477 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  96.91 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  96.91 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  83.97 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  76.54 
 
 		 162 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  75.93 
 
 		 162 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  75.31 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  79.63 
 
 		 162 aa  254  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  76.58 
 
 		 160 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  56.21 
 
 		 155 aa  168  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  55.19 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  55.13 
 
 		 154 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  50.98 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  54.9 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  51.95 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  47.44 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  35.88 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  37.34 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  28.99 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  32.69 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  29.56 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  29.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  36.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  31.08 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  29.47 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  25.16 
 
 		 280 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  40 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  24.54 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  24.4 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  39.22 
 
 		 193 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  38.78 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  54.29 
 
 		 185 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  38.78 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  43.75 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  43.75 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  28.75 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  28.17 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>