35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1142 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  33.96 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  31.33 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  31.08 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  30.67 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  32.03 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  31.79 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  30 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  30.07 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  28.67 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  30.26 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  24.31 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  29.53 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  29.3 
 
 		 162 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  40.74 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  23.65 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  28.92 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  28.92 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  29.63 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  27.82 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02523  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  30.93 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  32.29 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  30.61 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  28.83 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  28.1 
 
 		 163 aa  40  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0067  hypothetical protein  36.76 
 
 		 169 aa  40  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>