82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2001 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  31.13 
 
 		 199 aa  67.8  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  35.63 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  36.25 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  36.11 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  25.3 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  33.66 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  33.33 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  44.07 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  34.72 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  26.32 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  34.78 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  34.78 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3664  general secretion pathway protein H  24.22 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  37.31 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  29.35 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1794  hypothetical protein  44.9 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.786211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  50 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  31.08 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  44.9 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  36.05 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  32.31 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  24.16 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.86 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.11 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  29.27 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  33.82 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  31.94 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  23.4 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  31.17 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.82 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  25.32 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  60.53 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  25.93 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  37.7 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  25.93 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  33.8 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.52 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  54.05 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  24.83 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  29.73 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  51.22 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  28.45 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  42.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  35.44 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  46.51 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  27.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  23.65 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  51.35 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  47.62 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  23.65 
 
 		 144 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 143 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  33.33 
 
 		 163 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  46.34 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  46.34 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  28.97 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  48.65 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  33.9 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  29.59 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  30.12 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  46.51 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  40.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  23.53 
 
 		 121 aa  40.8  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  52.78 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  26.79 
 
 		 185 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  36.54 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  44.74 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  30 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>