52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3759 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  59.62 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  58.33 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  55.13 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  55.41 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  51.92 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  53.85 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  53.46 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  49.68 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  51.63 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  50.98 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  55.33 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  50.98 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  53.21 
 
 		 162 aa  148  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  55.84 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  48 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  38.07 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  29.48 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  33.54 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  40.58 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  29.49 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  29.35 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  40.74 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  25 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  28.48 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  37.5 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  29.13 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  34.55 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1549  N-terminal methylation  32.88 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.143316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  50 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  54.29 
 
 		 192 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  55.88 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3102  hypothetical protein  32.81 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  30.43 
 
 		 165 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 		 149 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  34.09 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3866  hypothetical protein  52.94 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  32.35 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  48.65 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0464  hypothetical protein  52.94 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  53.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  51.35 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  35 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>