36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002378 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002378  MSHA pilin protein MshC  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03690  hypothetical protein  52.67 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  34.43 
 
 		 204 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  32.91 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  42.31 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  36.36 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  41.67 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  28.75 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  26.67 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  62.5 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  55.88 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  39.71 
 
 		 125 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01338  hypothetical protein  43.33 
 
 		 195 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  26.58 
 
 		 159 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  32.26 
 
 		 167 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  40.74 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3698  methylation site containing protein  55.88 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.452925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  40.74 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  35 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  40.82 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  40.74 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  52.94 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  62.96 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4159  hypothetical protein  52.94 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  51.61 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  56.25 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  26.71 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3316  methylation site containing protein  50 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.192216  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  57.89 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  62.96 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  41.51 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  38.16 
 
 		 283 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>