70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0224 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  44.68 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  38.99 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  36.8 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0572  N-terminal methylation  39.19 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0433  hypothetical protein  34.8 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00311191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0481  hypothetical protein  35.22 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.378342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0451  hypothetical protein  34.35 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1525  hypothetical protein  34.35 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  43.08 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  40 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  47.62 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  76.92 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  74.07 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  76.92 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  76.92 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  76.92 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  73.08 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  34.94 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  46.51 
 
 		 156 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  76.92 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  76.92 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  46.67 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  39.53 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.49 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  80 
 
 		 141 aa  45.1  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  55.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  55.56 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  29.49 
 
 		 144 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  55.56 
 
 		 171 aa  45.1  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  37.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  35.14 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.86 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  65.38 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  40 
 
 		 567 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.34 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.83 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  25.74 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.64 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  32.14 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  43.18 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  45.24 
 
 		 150 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  28.21 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  38.3 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  45.24 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.1 
 
 		 142 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  38.89 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  38.3 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.21 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  41.18 
 
 		 527 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  41.18 
 
 		 634 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.78 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35.21 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  46.15 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  44.19 
 
 		 153 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  40.38 
 
 		 548 aa  42  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 144 aa  42  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1477  hypothetical protein  60.53 
 
 		 163 aa  42  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.740331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1478  hypothetical protein  60.53 
 
 		 163 aa  42  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.930132  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  43.59 
 
 		 182 aa  42  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  45.24 
 
 		 144 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  65.38 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.64 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0868  transformation system protein  52.63 
 
 		 67 aa  41.6  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.371392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  39.29 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>