29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0572 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0572  N-terminal methylation  100 
 
 
216 aa  447  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  45.13 
 
 
225 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  38.16 
 
 
231 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  41.31 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  39.19 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0481  hypothetical protein  31.88 
 
 
245 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.378342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1525  hypothetical protein  31 
 
 
245 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0451  hypothetical protein  31.44 
 
 
245 aa  121  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0433  hypothetical protein  30.74 
 
 
246 aa  109  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  44.44 
 
 
156 aa  48.5  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  25.57 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  43.75 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  46.51 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0578  N-terminal methylation  38.96 
 
 
97 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  37.78 
 
 
171 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  42.86 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  37.78 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  35.56 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  42.22 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  66.67 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  53.12 
 
 
133 aa  45.8  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  35.56 
 
 
169 aa  45.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  50 
 
 
186 aa  45.1  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  40.43 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  62.96 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  26.74 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  32.79 
 
 
168 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  56.67 
 
 
135 aa  42.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  41.03 
 
 
172 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>