24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1679 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0572  N-terminal methylation  45.13 
 
 
216 aa  158  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  36.8 
 
 
220 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  41.82 
 
 
232 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  36.32 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0433  hypothetical protein  31.17 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00311191  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0481  hypothetical protein  31.17 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.378342  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0451  hypothetical protein  30.74 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1525  hypothetical protein  29.87 
 
 
245 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  80 
 
 
143 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  58.62 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  30.84 
 
 
136 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  76 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  65.52 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  62.07 
 
 
156 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  37.7 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  36.99 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  65.52 
 
 
171 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  68 
 
 
153 aa  42  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  62.07 
 
 
169 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  27.85 
 
 
156 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  28.57 
 
 
169 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  68 
 
 
152 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  30.93 
 
 
146 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>