93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0837 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0837  N- methylation  100 
 
 
232 aa  485  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.288173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  42.92 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1487  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  44 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  41.82 
 
 
225 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0572  N-terminal methylation  41.31 
 
 
216 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0451  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0481  hypothetical protein  32.29 
 
 
245 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.378342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1525  hypothetical protein  31.39 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0433  hypothetical protein  31.12 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1110  N-terminal methylation domain-containing protein  60.42 
 
 
156 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.383546  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  45.07 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  46.25 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1599  N-terminal methylation domain-containing protein  69.44 
 
 
152 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  82.14 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  78.57 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  78.57 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1385  N- methylation  78.57 
 
 
133 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1598  lipoprotein ABC transporter permease  70.59 
 
 
143 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  32.89 
 
 
190 aa  51.6  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0115  N-terminal methylation domain-containing protein  54.9 
 
 
135 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1532  transformation system protein  31.46 
 
 
171 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0367  transformation system protein  30.34 
 
 
169 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  30.11 
 
 
178 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1342  transformation system protein  64.29 
 
 
171 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.81 
 
 
154 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  33.33 
 
 
165 aa  48.5  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  38.89 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0320  N- methylation  29.63 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  31.75 
 
 
172 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0028  putative transformation system protein  44.68 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00183971  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  34.38 
 
 
155 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  36.71 
 
 
634 aa  45.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  39.62 
 
 
527 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0366  N-terminal methylation  75 
 
 
132 aa  45.1  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  59.26 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0864  N-terminal methylation domain-containing protein  61.54 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.69 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.78 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  59.26 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.25 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  42.59 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  32.81 
 
 
168 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  34.38 
 
 
163 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.48 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
167 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
161 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  51.72 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.69 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  55.56 
 
 
164 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  41.94 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  38.46 
 
 
567 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.34 
 
 
158 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  60.61 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  28.97 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.56 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  51.61 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.72 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
163 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
172 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 
165 aa  43.5  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
156 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  55.56 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48.39 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
166 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  30.16 
 
 
152 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0367  N-terminal methylation  47.37 
 
 
145 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 
163 aa  42.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
152 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  43.9 
 
 
174 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.15 
 
 
172 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
167 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
157 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
156 aa  42.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  55.56 
 
 
136 aa  42  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  61.54 
 
 
156 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0866  N-terminal methylation domain-containing protein  57.69 
 
 
210 aa  42  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.870147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  31.25 
 
 
188 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  55.56 
 
 
48 aa  42  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 
169 aa  42  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.16 
 
 
171 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  55.56 
 
 
144 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  55.56 
 
 
144 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  55.56 
 
 
139 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
161 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.21 
 
 
179 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.72 
 
 
174 aa  41.6  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>