12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3286 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  30.67 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  34.92 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  43.86 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  37.5 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  33.33 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  26.42 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  29.41 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1679  hypothetical protein  36.99 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  39.29 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  26.77 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0657  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.385115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>