14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0591 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  91.48 
 
 		 176 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  56.63 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  44 
 
 		 178 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1277  general secretion pathway protein H  38.51 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0325  general secretion pathway protein H, putative  43.12 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  25.26 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1033  hypothetical protein  22.8 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  35.71 
 
 		 166 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  24.74 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  24.74 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  26.42 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  47.62 
 
 		 176 aa  42  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>