28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0325 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0325  general secretion pathway protein H, putative  100 
 
 		 175 aa  350  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  54.75 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  47.59 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  42.77 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  43.12 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1277  general secretion pathway protein H  32.3 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  36.23 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  31.82 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  34.78 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  34.78 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  38.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  37.74 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  28.04 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  37.74 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  28.72 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  46 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  37.74 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3339  methylation  32.84 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  26.38 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  33.94 
 
 		 189 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  40 
 
 		 129 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  32 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  31.82 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  28.89 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.33 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  28.74 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>