26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1277 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1277  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 170 aa  340  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0604  general secretion pathway protein H  42.24 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000151155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0679  hypothetical protein  38.65 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0591  hypothetical protein  38.51 
 
 		 198 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  35.12 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0325  general secretion pathway protein H, putative  32.3 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  28.26 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0716  hypothetical protein  27.69 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  27.5 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  38.24 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  26.77 
 
 		 203 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  30.3 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  41.38 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  31.52 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0726  hypothetical protein  24.75 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  31.65 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  26.74 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  22.5 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  47.37 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  33.82 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  27.34 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0224  N- methylation  29.73 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  25.49 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>