135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1352 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  100 
 
 
177 aa  359  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  37.8 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  33.14 
 
 
202 aa  84.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  30.9 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  32.65 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  29.45 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  33.1 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  31.41 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  25.65 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  26.38 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  24.59 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  26.7 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  26.88 
 
 
204 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  26.88 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  26.88 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  26.88 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  25.93 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  30.41 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  25.3 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  28.97 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  27.71 
 
 
192 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  23.81 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  23.81 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0319  general secretion pathway protein H  32.04 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  28.99 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  28.99 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  27.22 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 
142 aa  47.8  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  44.07 
 
 
145 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  37.5 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  24.86 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3368  general secretion pathway protein H  31.78 
 
 
178 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1303  general secretion pathway protein H  21.82 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1412  outer membrane secretion protein U  32.72 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  34.48 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  38.78 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  43.1 
 
 
142 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  34.62 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  33.77 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  24.68 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  34 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  29.41 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3222  general secretion pathway protein H  28.35 
 
 
166 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  34 
 
 
146 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
146 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  31.46 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  27.55 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
150 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  38 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  43.48 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  36.54 
 
 
148 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  27.55 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  62.5 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55520  type II secretion system protein  34.41 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0464256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  44.23 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  27.55 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  39.66 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3195  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255687  hitchhiker  0.00307792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
138 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  32.76 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  31 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1897  general secretion pathway protein H  25.69 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  26.53 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.44 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
143 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.03 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0682  hypothetical protein  37.14 
 
 
203 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0717  hypothetical protein  37.14 
 
 
203 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  38.24 
 
 
121 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1122  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.711782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 
150 aa  42  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4832  general secretion pathway protein H  30.37 
 
 
149 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  31.9 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  54.55 
 
 
187 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>