60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4247 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4247  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  43.42 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  43.42 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  43.42 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  42.11 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  42.11 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1008  general secretion pathway protein H  23.98 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  35.11 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  24.1 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1474  general secretion pathway protein H  25.71 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2922  general secretion pathway protein H  29.75 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.252681  normal  0.157804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  30.53 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  32.29 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  37.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  32.98 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  36.19 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2895  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 160 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  36.19 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  34.29 
 
 		 114 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  23.9 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  34.44 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  29.47 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  45.1 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34.67 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  29.13 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  46 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  32 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  43.4 
 
 		 146 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 157 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  28.76 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  30.32 
 
 		 190 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  26.09 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  41.67 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  27.17 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  27.27 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  24.53 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  29 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.77 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  30 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  53.33 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.76 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  36.59 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  28.87 
 
 		 142 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>